選品范圍的差異
Amazon FBA倉對選品的尺寸、重量、類別有一定程度的限制，所以選品偏向于體積小、高潤好、質量好的產品；
如果是選擇第三方海外倉，選品范圍比FBA倉的廣一些，像體積大、重量大的產品也適合。換個說法，即能進入Amazon FBA倉的產品必定能進入第三方海外倉，但能進入第三方海外倉的產品不一定能進入Amazon FBA倉。
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頭程服務的差異
Amazon FBA倉不會為賣家提供頭程清關服務；
部分第三方海外倉服務商會給賣家提供頭程清關服務，甚至還會有包含代繳稅金、派送到倉的一條龍服務。
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1、二者都需要賣家提前備貨，都具有很好的倉儲管理經驗，無需賣家操心倉儲與配送問題。
2、都可以縮短配送時間，提升客戶的滿意度，對店鋪的銷售額增長有幫助。
3、都需要賣家批量發貨，發貨的方式一般選擇空運、快遞、海運，能有效避免物流高峰。
4、都可以為買家提供退換貨服務。
5、無論選擇FBA倉還是第三方海外倉，賣家每月都需繳納倉租費，物流費用和其他費用。
6、產品在賣家的控制之外，但二者都有客服服務提供，讓賣家知悉庫存情況。

Amazon FBA倉的入倉要求較為嚴格，需要賣家在發貨前在處理貼好外箱標簽及產品標簽，如果外箱或產品標簽有破損的話，會要求賣家先整理，然后才能進入FBA倉。且Amazon 也不提供產品裝組服務；
第三方海外倉的入庫要求不會像Amazon FBA倉這么高，在上架前會會提供整理、組裝產品的服務。

選擇FBA，Amazon 平臺會對增加賣家產品的爆光度，如提高賣家的Listing排名、幫助賣家搶奪購物車等，這些都有利于提高賣家店鋪的流量與銷量。
如果是選擇第三方海外倉的話，海外倉服務商是不可能像Amazon 那樣，給賣家的產品提供平臺或在平臺上增加爆光度。賣家需要自己做站內外的推廣來增加店鋪的業績。

簡單一點說：
FBA就是亞馬遜自己的倉儲物流，受制于亞馬遜。做亞馬遜的賣家更有優勢。
海外倉就是海外第三方倉儲物流，不限于哪方跨境電商平臺。做多種跨境電商平臺更有優勢。

亞馬遜FBA其實也是海外倉，不過是姓-亞馬遜的
而其他的一些服務商的海外倉或者你自己建的海外倉，是自由調度的，也可以經營多個平臺

海外倉可以彌補FBA的以下三大難題：
1，退貨難題：退貨可以從FBA退出來檢查、維修重新上架。
2，物流成本難題：FBA通過海外倉海運轉發，減低物流成本。
3，換標難題：產品的包裝或者其他原因需要退出來重新換標簽。